Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTP4A2Q12974 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PTP4A2Q12974 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTP4A2Q12974 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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