Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 ALG8YOR067C 1734 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SGO1YOR073W 1773 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 ROG3YFR022W 2202 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 RGT1YKL038W 3513 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YFL015CYFL015C 495 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 HHF2YNL030W 312 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YOR050CYOR050C 348 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 RPL21BYPL079W 483 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 PDB1YBR221C 1101 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 UBX5YDR330W 1503 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 ADE4YMR300C 1533 nt5.67□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SKG3YLR187W 3081 nt5.66□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 ALD3YMR169C 1521 nt5.66□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YIL024CYIL024C 570 nt5.66□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.66□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 DHR2YKL078W 2208 nt5.66□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 TRS85YDR108W 2097 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SOK2YMR016C 2358 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 UTP13YLR222C 2454 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 AGA1YNR044W 2178 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 ATP17YDR377W 306 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YHL026CYHL026C 948 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 RPS4BYHR203C 786 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YPL025CYPL025C 558 nt5.65□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 MAG2YLR427W 2013 nt5.65□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 MCX1YBR227C 1563 nt5.64□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 SIP2YGL208W 1248 nt5.64□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 LDS2YOL047C 1071 nt5.64□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YOR365CYOR365C 2112 nt5.64□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 IMA2YOL157C 1770 nt5.64□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YGL036WYGL036W 2730 nt5.64□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YNL179CYNL179C 438 nt5.63□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YNR042WYNR042W 429 nt5.63□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 MSR1YHR091C 1932 nt5.63□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 TRF5YNL299W 1929 nt5.63□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YVC1YOR087W 2028 nt5.63□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 RRN3YKL125W 1884 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 PRK1YIL095W 2433 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 SLK19YOR195W 2466 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 ADK1YDR226W 669 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 PAU14YIL176C 363 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 PAU1YJL223C 363 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 RPL36BYPL249C-A 303 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 RIM101YHL027W 1878 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 AVT3YKL146W 2079 nt5.62□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 VTH1YIL173W 4650 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 VTH2YJL222W 4650 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 RPS11AYDR025W 471 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YDR355CYDR355C 303 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 VTC2YFL004W 2487 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YGL042CYGL042C 306 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YIR040CYIR040C 333 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 CYB5YNL111C 363 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 RTS1YOR014W 2274 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 DDC1YPL194W 1839 nt5.61□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 PCF11YDR228C 1881 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YER066C-AYER066C-A 501 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YGL074CYGL074C 327 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YNL057WYNL057W 333 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 SCY1YGL083W 2415 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 MON1YGL124C 1935 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 ASG1YIL130W 2895 nt5.6□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 MPS3YJL019W 2049 nt5.59□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YGL217CYGL217C 342 nt5.59□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 RPS23AYGR118W 438 nt5.59□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt5.59□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 snR52snR52 92 nt5.59□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 MSH1YHR120W 2880 nt5.59□□□□□ -1.51
NCR1Q12200 TKL1YPR074C 2043 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 RIM20YOR275C 1986 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 ARO2YGL148W 1131 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 CWC24YLR323C 780 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YML037CYML037C 1023 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 EIS1YMR031C 2532 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 SIA1YOR137C 1869 nt5.58□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 DBF4YDR052C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 VPS45YGL095C 1734 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 BEM4YPL161C 1902 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YGL072CYGL072C 360 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 UPS1YLR193C 528 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YPR136CYPR136C 513 nt5.57□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 MSS4YDR208W 2340 nt5.56□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 NAG1YGR031C-A 492 nt5.56□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 ECM15YBL001C 315 nt5.56□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 MRP8YKL142W 660 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 YLR296WYLR296W 327 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 KIP2YPL155C 2121 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 SLM6YBR266C 453 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 CLA4YNL298W 2529 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 GSM1YJL103C 1857 nt5.55□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 VPS1YKR001C 2115 nt5.54□□□□□ -1.52
NCR1Q12200 DBF2YGR092W 1719 nt5.54□□□□□ -1.52
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