Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC5P28715 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms