Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAD1O00515 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAD1O00515 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAD1O00515 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAD1O00515 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAD1O00515 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAD1O00515 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms