Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNIKQ9UKE5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms