Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms