Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSEN34Q9BSV6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms