Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNE4Q8N205 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms