Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHA9Q7RTU4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms