Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3KQ59H18 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3KQ59H18 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3KQ59H18 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3KQ59H18 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TNNI3KQ59H18 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3KQ59H18 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms