Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIGQ13278 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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