Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 FMP41YNL168C 780 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 IRC13YOR235W 315 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 RPN8YOR261C 1017 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YBR209WYBR209W 318 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YMR046CYMR046C 1323 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YIL080WYIL080W 4722 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 RIM13YMR154C 2184 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 IPI3YNL182C 1668 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 MDM36YPR083W 1740 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 SAK1YER129W 3429 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 EMI1YDR512C 564 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 LIP2YLR239C 987 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 ANR2YKL047W 1551 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF8Q12483 STE11YLR362W 2154 nt2.34□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 POM152YMR129W 4014 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 CPR5YDR304C 678 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 RGI1YER067W 486 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YHR212CYHR212C 336 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YAR060CYAR060C 336 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YNL276CYNL276C 396 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YOL134CYOL134C 390 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 PHO2YDL106C 1680 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YKR078WYKR078W 1758 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 SYO1YDL063C 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 KRE33YNL132W 3171 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 VEL1YGL258W 621 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 VMA10YHR039C-A 345 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 RPS1AYLR441C 768 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 AIM36YMR157C 768 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 COQ10YOL008W 624 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 BAG7YOR134W 1230 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 ATP3YBR039W 936 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 CCL1YPR025C 1182 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 CSH1YBR161W 1131 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 PSD2YGR170W 3417 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 TRM2YKR056W 1920 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 FAR11YNL127W 2862 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 APC11YDL008W 498 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 LSM4YER112W 564 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 SEC4YFL005W 648 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 OTU2YHL013C 924 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 CWC24YLR323C 780 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 RPS29AYLR388W 171 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 KAR4YCL055W 1008 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 TRM82YDR165W 1335 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 AGE1YDR524C 1449 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YLR108CYLR108C 1458 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 UTP15YMR093W 1542 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 UBP15YMR304W 3693 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 SVL3YPL032C 2478 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YPD1YDL235C 504 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YHL044WYHL044W 708 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 CCE1YKL011C 1062 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 BET3YKR068C 582 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 BOS1YLR078C 735 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 MST28YAR033W 705 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 ARC18YLR370C 537 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 SAS2YMR127C 1017 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 KTI11YBL071W-A 249 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YOR277CYOR277C 309 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 PDR11YIL013C 4236 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 NOP56YLR197W 1515 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 ERT1YBR239C 1590 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 ARK1YNL020C 1917 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 SKP2YNL311C 2292 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 NEW1YPL226W 3591 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 NEL1YHR035W 1893 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YGL176CYGL176C 1665 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 GCD10YNL062C 1437 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 PLP1YDR183W 693 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 NOP19YGR251W 591 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YIL141WYIL141W 390 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 SED5YLR026C 1023 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YMR181CYMR181C 465 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 CBP6YBR120C 489 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 PHO91YNR013C 2685 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 PBS2YJL128C 2007 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 BI3Q0115 1554 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 OSW7YFR039C 1533 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 NOP12YOL041C 1380 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YCR064CYCR064C 411 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YFL015CYFL015C 495 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YGL177WYGL177W 348 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 ALB1YJL122W 528 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 EMC6YLL014W 327 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 FYV6YNL133C 522 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF8Q12483 YPL142CYPL142C 318 nt2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.1 ms