Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 VPS64YDR200C 1815 nt3.14□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 CDC20YGL116W 1833 nt3.14□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YHR078WYHR078W 1659 nt3.14□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YMR018WYMR018W 1545 nt3.14□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 VAC8YEL013W 1737 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 CIK1YMR198W 1785 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 RSM24YDR175C 960 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YGL109WYGL109W 324 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YPT52YKR014C 705 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 SRL3YKR091W 741 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YNL089CYNL089C 477 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 BRX1YOL077C 876 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 RRG7YOR305W 729 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 TAF2YCR042C 4224 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 NMA111YNL123W 2994 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 CBP2YHL038C 1893 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 KRE2YDR483W 1329 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 SQS1YNL224C 2304 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 BPT1YLL015W 4680 nt3.13□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 STP2YHR006W 1626 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 SLD5YDR489W 885 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 VFA1YER128W 612 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 RPL14BYHL001W 417 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YIR040CYIR040C 333 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 RNR2YJL026W 1200 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 ARC18YLR370C 537 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YPL142CYPL142C 318 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YPL276WYPL276W 438 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 BRE5YNR051C 1548 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 NAB3YPL190C 2409 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 NOP12YOL041C 1380 nt3.12□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 EAP1YKL204W 1899 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 TOM70YNL121C 1854 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 DIA2YOR080W 2199 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 STN1YDR082W 1485 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YCR099CYCR099C 468 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 LOC1YFR001W 615 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 PNC1YGL037C 651 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YMR141CYMR141C 309 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 DYN3YMR299C 939 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 GRE2YOL151W 1029 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 KHA1YJL094C 2622 nt3.11□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 AGE1YDR524C 1449 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 CDH1YGL003C 1701 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 VAS1YGR094W 3315 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 SLK19YOR195W 2466 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YDR203WYDR203W 318 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YEA4YEL004W 1029 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 MVB12YGR206W 306 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 LIN1YHR156C 1023 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 LSM8YJR022W 330 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 CAP1YKL007W 807 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 MRPL38YKL170W 417 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 ADI1YMR009W 540 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 DYN1YKR054C 12279 nt3.1□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 SRC1YML034W 2505 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YDL032WYDL032W 312 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 RSM28YDR494W 1086 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 YHL044WYHL044W 708 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 GPI14YJR013W 1212 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 NBP1YLR457C 960 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 ATX1YNL259C 222 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 CBP6YBR120C 489 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 SWD3YBR175W 948 nt3.09□□□□□ -1.91
RIM20Q12033 ESL2YKR096W 3588 nt3.09□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YJL132WYJL132W 2253 nt3.09□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 HOP1YIL072W 1818 nt3.09□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 DOA4YDR069C 2781 nt3.09□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 BCK1YJL095W 4437 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 EXO84YBR102C 2262 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YGR018CYGR018C 330 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YNL050CYNL050C 813 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 ATP11YNL315C 957 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 BUD21YOR078W 645 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YAK1YJL141C 2424 nt3.08□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 SKO1YNL167C 1944 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 YCR013CYCR013C 648 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 HMO1YDR174W 741 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 PGD1YGL025C 1194 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 EST3YIL009C-A 546 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 SHG1YBR258C 429 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 NSA1YGL111W 1392 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 AVT2YEL064C 1443 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 APM3YBR288C 1452 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 RTT10YPL183C 3042 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 ANR2YKL047W 1551 nt3.07□□□□□ -1.92
RIM20Q12033 MED1YPR070W 1701 nt3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 115.7 ms