Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC63Q05C16 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC63Q05C16 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms