Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YHR213WYHR213W 597 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 VPS25YJR102C 609 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 BET3YKR068C 582 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 LIP2YLR239C 987 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YAR062WYAR062W 597 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 UBP15YMR304W 3693 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 BAG7YOR134W 1230 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YOR277CYOR277C 309 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 TFB1YDR311W 1929 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 BIT61YJL058C 1632 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SUL1YBR294W 2580 nt2.38□□□□□ -2.03
DDI1P40087 HAA1YPR008W 2085 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 AGE1YDR524C 1449 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YBT1YLL048C 4986 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 NRG1YDR043C 696 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 PLP1YDR183W 693 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 ARC18YLR370C 537 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 AIM36YMR157C 768 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 PEX17YNL214W 600 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SVL3YPL032C 2478 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 PHO2YDL106C 1680 nt2.37□□□□□ -2.03
DDI1P40087 DNA2YHR164C 4569 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 UBC9YDL064W 474 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 DPP1YDR284C 870 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 ERV1YGR029W 570 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YIL141WYIL141W 390 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 BOS1YLR078C 735 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SAS2YMR127C 1017 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YSF3YNL138W-A 258 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RPS12YOR369C 432 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SYO1YDL063C 1863 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 CSF1YLR087C 8877 nt2.36□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SIR3YLR442C 2937 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SSN2YDR443C 4263 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YFL015CYFL015C 495 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YGL177WYGL177W 348 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 HTD2YHR067W 843 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 ARG3YJL088W 1017 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YKL131WYKL131W 522 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RPS1AYLR441C 768 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 FYV6YNL133C 522 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 ERT1YBR239C 1590 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 DNL4YOR005C 2835 nt2.35□□□□□ -2.03
DDI1P40087 ARK1YNL020C 1917 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 PDS5YMR076C 3834 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 RLI1YDR091C 1827 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YFR054CYFR054C 579 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 COG7YGL005C 840 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YGL039WYGL039W 1047 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SAE2YGL175C 1038 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SED5YLR026C 1023 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 CWC24YLR323C 780 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 MER1YNL210W 813 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 ATG3YNR007C 933 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 DAD3YBR233W-A 285 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 YKU80YMR106C 1890 nt2.34□□□□□ -2.03
DDI1P40087 SMY2YBR172C 2223 nt2.34□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YOL098CYOL098C 3114 nt2.34□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YIL080WYIL080W 4722 nt2.34□□□□□ -2.04
DDI1P40087 NOP12YOL041C 1380 nt2.34□□□□□ -2.04
DDI1P40087 VAC8YEL013W 1737 nt2.34□□□□□ -2.04
DDI1P40087 ORC1YML065W 2745 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 ISW1YBR245C 3390 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YEL010WYEL010W 351 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YJL114WYJL114W 681 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 COX14YML129C 213 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YMR181CYMR181C 465 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YOR055WYOR055W 435 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YJL049WYJL049W 1353 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 SNX41YDR425W 1878 nt2.33□□□□□ -2.04
DDI1P40087 AEP1YMR064W 1557 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 PSF2YJL072C 642 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YKL066WYKL066W 444 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 COA4YLR218C 453 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 DYN3YMR299C 939 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 NGL1YOL042W 1092 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YPL142CYPL142C 318 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YBR209WYBR209W 318 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 snR44snR44 211 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 GCV2YMR189W 3105 nt2.32□□□□□ -2.04
DDI1P40087 NEW1YPL226W 3591 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YJL181WYJL181W 1836 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 TPS2YDR074W 2691 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 APC11YDL008W 498 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 MAM1YER106W 909 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 MRPL17YNL252C 846 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 COQ10YOL008W 624 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 UFE1YOR075W 1041 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 BTS1YPL069C 1008 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 JJJ2YJL162C 1752 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 TOP2YNL088W 4287 nt2.31□□□□□ -2.04
DDI1P40087 TOF1YNL273W 3717 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 OTU2YHL013C 924 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 ALB1YJL122W 528 nt2.3□□□□□ -2.04
DDI1P40087 FAR3YMR052W 615 nt2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.2 ms