Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 ROK1YGL171W 1695 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YJR003CYJR003C 1560 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPN6YDL097C 1305 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YDL068WYDL068W 330 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPS8BYER102W 603 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 LAG1YHL003C 1236 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YNR042WYNR042W 429 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 MET31YPL038W 534 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 PEX6YNL329C 3093 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 MNR2YKL064W 2910 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RNH70YGR276C 1662 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YOL019WYOL019W 1656 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 SBE2YDR351W 2595 nt5.08□□□□□ -1.6
SPT5P27692 GWT1YJL091C 1473 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 EAP1YKL204W 1899 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 ARF2YDL137W 546 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 HNT2YDR305C 654 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 CWC24YLR323C 780 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 HFA1YMR207C 6372 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YMR102CYMR102C 2505 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 ASI1YMR119W 1875 nt5.07□□□□□ -1.6
SPT5P27692 BBC1YJL020C 3474 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 PUB1YNL016W 1362 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPS4BYHR203C 786 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 HIS5YIL116W 1158 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPS4AYJR145C 786 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YBL028CYBL028C 321 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 PIS1YPR113W 663 nt5.06□□□□□ -1.6
SPT5P27692 TRX3YCR083W 384 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 ILV5YLR355C 1188 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 MRPL39YML009C 213 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPL16BYNL069C 597 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 PEX17YNL214W 600 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 TIM18YOR297C 579 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YLR177WYLR177W 1887 nt5.05□□□□□ -1.6
SPT5P27692 TRM44YPL030W 1704 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 STE5YDR103W 2754 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YER038W-AYER038W-A 381 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YGR269WYGR269W 327 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 MDG1YNL173C 1101 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 LYS2YBR115C 4179 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 DAP2YHR028C 2457 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 NUG1YER006W 1563 nt5.04□□□□□ -1.6
SPT5P27692 SKN7YHR206W 1869 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 ALR2YFL050C 2577 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPS29BYDL061C 171 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YGL042CYGL042C 306 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 RPL19BYBL027W 570 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 YPT53YNL093W 663 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 TGL4YKR089C 2733 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT5P27692 PCK1YKR097W 1650 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 PMT6YGR199W 2280 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 CGR1YGL029W 363 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YGR107WYGR107W 450 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 RPL39YJL189W 156 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 CNB1YKL190W 528 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 HHF2YNL030W 312 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 snR36snR36 182 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 HOP1YIL072W 1818 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YMR196WYMR196W 3267 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YEL067CYEL067C 588 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YFR054CYFR054C 579 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 RNR4YGR180C 1038 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YLR031WYLR031W 561 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 RPP0YLR340W 939 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 IMP4YNL075W 873 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YOR146WYOR146W 306 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 NHP6AYPR052C 282 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 PIN4YBL051C 2007 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 KIC1YHR102W 3243 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT5P27692 MNN1YER001W 2289 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 OSH6YKR003W 1347 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 SSB1YDL229W 1842 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 SSB2YNL209W 1842 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 UTP13YLR222C 2454 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 COX7YMR256C 183 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 HHT2YNL031C 411 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 FEX1YOR390W 1128 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 FEX2YPL279C 1128 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 VAC14YLR386W 2643 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 MKT1YNL085W 2493 nt5□□□□□ -1.61
SPT5P27692 RTC1YOL138C 4026 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YER107W-AYER107W-A 321 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 RPL1BYGL135W 654 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 VEL1YGL258W 621 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YBL108WYBL108W 306 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 RPL1AYPL220W 654 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 IRC3YDR332W 2070 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YDR338CYDR338C 2088 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YCK2YNL154C 1641 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YAP1802YGR241C 1707 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YGR242WYGR242W 309 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT5P27692 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT5P27692 APS1YLR170C 471 nt4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94 ms