Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms