Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
EEA1Q15075 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
EEA1Q15075 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
EEA1Q15075 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
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