Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 TFA2YKR062W 987 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 CDC123YLR215C 1083 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 ALK2YBL009W 2031 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 ERV41YML067C 1059 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YNL035CYNL035C 1170 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YBL096CYBL096C 309 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YSA1YBR111C 696 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 STN1YDR082W 1485 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 RLI1YDR091C 1827 nt1.87□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 SEC16YPL085W 6588 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 ORC2YBR060C 1863 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YCR015CYCR015C 954 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 SCL1YGL011C 759 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 DUO1YGL061C 744 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 SAW1YAL027W 786 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 VPS51YKR020W 495 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YLR311CYLR311C 348 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 PSY3YLR376C 729 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 RPS1AYLR441C 768 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 snR43snR43 209 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 ATP22YDR350C 2055 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 FIR1YER032W 2631 nt1.86□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 WHI3YNL197C 1986 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 TOP2YNL088W 4287 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 APL5YPL195W 2799 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 APC11YDL008W 498 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YDL118WYDL118W 381 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 ECM11YDR446W 909 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YIL161WYIL161W 708 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YLL047WYLL047W 384 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 DUG3YNL191W 1074 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 LTP1YPR073C 486 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YBR259WYBR259W 2067 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 RRP14YKL082C 1305 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YDR186CYDR186C 2634 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 AVT5YBL089W 1380 nt1.85□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 APC5YOR249C 2058 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 SSN2YDR443C 4263 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 AAD16YFL057C 459 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YGR168CYGR168C 1131 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 OMA1YKR087C 1038 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 RMP1YLR145W 606 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YML047W-AYML047W-A 366 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YOL114CYOL114C 609 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 YOR387CYOR387C 621 nt1.84□□□□□ -2.11
ATG41Q12048 NEO1YIL048W 3456 nt1.84□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 RPL35BYDL136W 363 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 PAU14YIL176C 363 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 PAU1YJL223C 363 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 SDO1YLR022C 753 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 NNT1YLR285W 786 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YOL057WYOL057W 2136 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YOR203WYOR203W 354 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 PRM4YPL156C 855 nt1.83□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 MPS2YGL075C 1164 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 RPS25AYGR027C 327 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 MPC3YGR243W 441 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 OTU2YHL013C 924 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 RRG8YPR116W 834 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 AIM4YBR194W 372 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 JIP5YPR169W 1479 nt1.82□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 HRD3YLR207W 2502 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 snR70snR70 164 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 TCA17YEL048C 459 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 RGI2YIL057C 495 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YSF3YNL138W-A 258 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 SRL1YOR247W 633 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 FIG1YBR040W 897 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 MUM2YBR057C 1101 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 MAK5YBR142W 2322 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 SEN54YPL083C 1404 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YIL080WYIL080W 4722 nt1.81□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 SPB1YCL054W 2526 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YDL026WYDL026W 312 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 TIM11YDR322C-A 291 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 ISC10YER180C 804 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 ERV1YGR029W 570 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 MTM1YGR257C 1101 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 AIM19YIL087C 474 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 UBC12YLR306W 567 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 CWC24YLR323C 780 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YBL012CYBL012C 402 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 HRT1YOL133W 366 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 GCV2YMR189W 3105 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 VTC3YPL019C 2508 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 ART10YLR392C 1557 nt1.8□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 COBQ0105 1158 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YJL169WYJL169W 369 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 TEX1YNL253W 1269 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 TPT1YOL102C 693 nt1.79□□□□□ -2.12
ATG41Q12048 YNL193WYNL193W 1677 nt1.79□□□□□ -2.12
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