Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 ATX1YNL259C 222 nt5.43□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 MRPL50YNR022C 420 nt5.43□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 DGK1YOR311C 873 nt5.43□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 TLC1TLC1 1301 nt5.43□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 SYF1YDR416W 2580 nt5.43□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 PUT2YHR037W 1728 nt5.43□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 GLC3YEL011W 2115 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 KEX1YGL203C 2190 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 RIM21YNL294C 1602 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 ARF2YDL137W 546 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 SIP2YGL208W 1248 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YIR014WYIR014W 729 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YJL015CYJL015C 285 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 RPA12YJR063W 378 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 JIP3YLR331C 378 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 ISF1YMR081C 1017 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 RPC40YPR110C 1008 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YJL132WYJL132W 2253 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 SNF3YDL194W 2655 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 DAK1YML070W 1755 nt5.42□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 ROY1YMR258C 1662 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YDR102CYDR102C 333 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YER079C-AYER079C-A 339 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YHL026CYHL026C 948 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YPL278CYPL278C 303 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YPR077CYPR077C 372 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 snR32snR32 188 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 MGS1YNL218W 1764 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YFL042CYFL042C 2025 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 ATG26YLR189C 3597 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 VPS9YML097C 1356 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 HIR2YOR038C 2628 nt5.41□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YBR238CYBR238C 2196 nt5.4□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 RNA14YMR061W 2034 nt5.4□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt5.4□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt5.4□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 ZEO1YOL109W 342 nt5.4□□□□□ -1.54
TYW1Q08960 EAP1YKL204W 1899 nt5.4□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SKG3YLR187W 3081 nt5.4□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YNL095CYNL095C 1929 nt5.4□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 OAF1YAL051W 3144 nt5.4□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 CPS1YJL172W 1731 nt5.4□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RAD52YML032C 1416 nt5.4□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 FOL1YNL256W 2475 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 MAL11YGR289C 1851 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SKN7YHR206W 1869 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 FUI1YBL042C 1920 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 GRX4YER174C 735 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YGR053CYGR053C 852 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RPL11BYGR085C 525 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YLR428CYLR428C 345 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RPL6BYLR448W 531 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 PEX17YNL214W 600 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RPL11AYPR102C 525 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 FAP1YNL023C 2898 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 VBA2YBR293W 1425 nt5.39□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 CAF4YKR036C 1932 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 CYC7YEL039C 342 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RPL1BYGL135W 654 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 HHF2YNL030W 312 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 BIL1YOR304C-A 231 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 MET31YPL038W 534 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RPL1AYPL220W 654 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 PHO88YBR106W 567 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 DPB3YBR278W 606 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YCL023CYCL023C 348 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 PEX6YNL329C 3093 nt5.38□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YOL019WYOL019W 1656 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 MED1YPR070W 1701 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YDL228CYDL228C 642 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SDH6YDR379C-A 240 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YGL165CYGL165C 579 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SAE3YHR079C-A 276 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 IRC18YJL037W 675 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 DSF2YBR007C 2211 nt5.37□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 NOC2YOR206W 2133 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 ATH1YPR026W 3636 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 RNR4YGR180C 1038 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 ILV5YLR355C 1188 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 PDC1YLR044C 1692 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 NRD1YNL251C 1728 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 GLN4YOR168W 2430 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 SAP4YGL229C 2457 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 STB2YMR053C 2553 nt5.36□□□□□ -1.55
TYW1Q08960 PSP1YDR505C 2526 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.5 ms