Protein–RNA interactions for Protein: P53962

YNL035C, Uncharacterized WD repeat-containing protein YNL035C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL035CP53962 FAT3YKL187C 2253 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 FRE3YOR381W 2136 nt5.93□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 SOG2YOR353C 2376 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 FUI1YBL042C 1920 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 YGR190CYGR190C 366 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 TDA11YHR159W 1515 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 STI1YOR027W 1770 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 RVB1YDR190C 1392 nt5.92□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 YMR102CYMR102C 2505 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 LRE1YCL051W 1752 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 MRPL51YPR100W 423 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 BRF1YGR246C 1791 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 YEL068CYEL068C 333 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 VPS55YJR044C 423 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 RPS7BYNL096C 573 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 MRPS16YPL013C 366 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL035CP53962 PPZ1YML016C 2079 nt5.9□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 UBP7YIL156W 3216 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 IMD2YHR216W 1572 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 PEX30YLR324W 1572 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 MET7YOR241W 1647 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 AAD15YOL165C 432 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 ATG12YBR217W 561 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 TOS3YGL179C 1683 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 HXT5YHR096C 1779 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 RKM1YPL208W 1752 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YML082WYML082W 1950 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 THI13YDL244W 1023 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 CPR5YDR304C 678 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 THI12YNL332W 1023 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 RPB10YOR210W 213 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 ISU2YOR226C 471 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 FRQ1YDR373W 573 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 MFA1YDR461W 111 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 CIN4YMR138W 576 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 HOR7YMR251W-A 180 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 snR10snR10 245 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 IMD4YML056C 1575 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 PUS1YPL212C 1635 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 SWP82YFL049W 1872 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YDR109CYDR109C 2148 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 PHO90YJL198W 2646 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 snR62snR62 100 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YDR262WYDR262W 819 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 ATO3YDR384C 828 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YGR022CYGR022C 330 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YKE2YLR200W 345 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YNL010WYNL010W 726 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 VAM10YOR068C 345 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 ECM25YJL201W 1800 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 ALG11YNL048W 1647 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 PIF1YML061C 2580 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 PAU2YEL049W 363 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 USE1YGL098W 738 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YKL069WYKL069W 543 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 CNB1YKL190W 528 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YGL036WYGL036W 2730 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 MPH2YDL247W 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 VPS1YKR001C 2115 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 GPB1YOR371C 2694 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 OCA5YHL029C 2040 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 SAC1YKL212W 1872 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 LHP1YDL051W 828 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 RPP1AYDL081C 321 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 OLI1Q0130 231 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 BIT2YBR270C 1638 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL035CP53962 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 STE14YDR410C 720 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 PSY1YKL076C 384 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 APE3YBR286W 1614 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YOS1YER074W-A 258 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 SBH1YER087C-B 249 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 TIM8YJR135W-A 264 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YNR042WYNR042W 429 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 snR13snR13 124 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YPL238CYPL238C 390 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 LTP1YPR073C 486 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 GRS1YBR121C 2004 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 MNN1YER001W 2289 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 DAK1YML070W 1755 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 snR72snR72 98 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 SRL1YOR247W 633 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 ULP1YPL020C 1866 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YDL180WYDL180W 1644 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 SEC27YGL137W 2670 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 BYE1YKL005C 1785 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 UTP25YIL091C 2166 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YBL044WYBL044W 369 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 MSS1YMR023C 1581 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 EXO1YOR033C 2109 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 UBX5YDR330W 1503 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 DHR2YKL078W 2208 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 GPT2YKR067W 2232 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL035CP53962 YDR154CYDR154C 351 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54 ms