Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YPT6YLR262C 648 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 RPL6BYLR448W 531 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 NBP1YLR457C 960 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 GOT1YMR292W 417 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ESL1YIL151C 3357 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 CBP2YHL038C 1893 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 VPS38YLR360W 1320 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SEN54YPL083C 1404 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 CIN8YEL061C 3003 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YLR108CYLR108C 1458 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YFH7YFR007W 1062 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 CDC123YLR215C 1083 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YLR217WYLR217W 324 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 PRM6YML047C 1059 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 RRG7YOR305W 729 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 MET10YFR030W 3108 nt2.93□□□□□ -1.94
MDE1P47095 FUN30YAL019W 3396 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 EXO5YBR163W 1758 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YOL057WYOL057W 2136 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ESC2YDR363W 1371 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YJL049WYJL049W 1353 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YNR063WYNR063W 1824 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YDR203WYDR203W 318 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SEC4YFL005W 648 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 PEX27YOR193W 1131 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 FLO11YIR019C 4104 nt2.92□□□□□ -1.94
MDE1P47095 TFB1YDR311W 1929 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 HFD1YMR110C 1599 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ERT1YBR239C 1590 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 NUR1YDL089W 1455 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 PIG2YIL045W 1617 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 MUB1YMR100W 1863 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YDR042CYDR042C 603 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 PDR17YNL264C 1053 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 INO4YOL108C 456 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ARL3YPL051W 597 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 RRG8YPR116W 834 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 KAR4YCL055W 1008 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YNL193WYNL193W 1677 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 HOP1YIL072W 1818 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 UTP14YML093W 2700 nt2.91□□□□□ -1.94
MDE1P47095 URK1YNR012W 1506 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 DRS2YAL026C 4068 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 UBC13YDR092W 462 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YHR054CYHR054C 1065 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 COX23YHR116W 456 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YIL054WYIL054W 318 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 DAL2YIR029W 1032 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YJL175WYJL175W 513 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 MCR1YKL150W 909 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YLR050CYLR050C 486 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YNL276CYNL276C 396 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YOR152CYOR152C 771 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 NIP7YPL211W 546 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 snR24snR24 89 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 NGG1YDR176W 2109 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 ESA1YOR244W 1338 nt2.9□□□□□ -1.95
MDE1P47095 ATG13YPR185W 2217 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 SHQ1YIL104C 1524 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 CHS2YBR038W 2892 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 RPS14AYCR031C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 FIN1YDR130C 876 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YGR115CYGR115C 780 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 RSR1YGR152C 819 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 MTM1YGR257C 1101 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 CAP1YKL007W 807 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YPT52YKR014C 705 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 SRL3YKR091W 741 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 VAC14YLR386W 2643 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YSF3YNL138W-A 258 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YNR025CYNR025C 360 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 KAP104YBR017C 2757 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 HUT1YPL244C 1020 nt2.89□□□□□ -1.95
MDE1P47095 ICR1ICR1 3199 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 SLH1YGR271W 5904 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YER138CYER138C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YER160CYER160C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YJR027WYJR027W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YML039WYML039W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YML045WYML045W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YMR050CYMR050C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 DUG2YBR281C 2637 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 MRH1YDR033W 963 nt2.88□□□□□ -1.95
MDE1P47095 GCD6YDR211W 2139 nt2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.1 ms