Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGM1P36871 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGM1P36871 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGM1P36871 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PGM1P36871 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PGM1P36871 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PGM1P36871 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms