Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHMG1C9JSJ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms