Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHA9Q7RTU4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.4 ms