Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC93Q567U6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC93Q567U6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms