Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RRN3P1Q2M238 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RRN3P1Q2M238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms