Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITGAEP38570 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ITGAEP38570 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ITGAEP38570 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms