Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NbnQ9R207 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NbnQ9R207 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NbnQ9R207 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NbnQ9R207 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NbnQ9R207 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NbnQ9R207 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NbnQ9R207 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NbnQ9R207 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms