Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Lamc3Q9R0B6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Lamc3Q9R0B6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Lamc3Q9R0B6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Lamc3Q9R0B6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Lamc3Q9R0B6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Lamc3Q9R0B6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Lamc3Q9R0B6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Lamc3Q9R0B6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Lamc3Q9R0B6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
Lamc3Q9R0B6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Lamc3Q9R0B6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Lamc3Q9R0B6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Lamc3Q9R0B6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Lamc3Q9R0B6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Lamc3Q9R0B6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Lamc3Q9R0B6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Lamc3Q9R0B6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
Lamc3Q9R0B6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Lamc3Q9R0B6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Lamc3Q9R0B6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Lamc3Q9R0B6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Lamc3Q9R0B6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Lamc3Q9R0B6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Lamc3Q9R0B6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Lamc3Q9R0B6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Lamc3Q9R0B6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Lamc3Q9R0B6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Lamc3Q9R0B6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Lamc3Q9R0B6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Lamc3Q9R0B6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Lamc3Q9R0B6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Lamc3Q9R0B6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lamc3Q9R0B6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lamc3Q9R0B6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lamc3Q9R0B6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Lamc3Q9R0B6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms