Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Lrrc9Q8CDN9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Lrrc9Q8CDN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Lrrc9Q8CDN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Lrrc9Q8CDN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Lrrc9Q8CDN9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Lrrc9Q8CDN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lrrc9Q8CDN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lrrc9Q8CDN9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Lrrc9Q8CDN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lrrc9Q8CDN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Lrrc9Q8CDN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
Lrrc9Q8CDN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Lrrc9Q8CDN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Lrrc9Q8CDN9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Lrrc9Q8CDN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lrrc9Q8CDN9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lrrc9Q8CDN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lrrc9Q8CDN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lrrc9Q8CDN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Lrrc9Q8CDN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Lrrc9Q8CDN9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Lrrc9Q8CDN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Lrrc9Q8CDN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lrrc9Q8CDN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Lrrc9Q8CDN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Lrrc9Q8CDN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lrrc9Q8CDN9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Lrrc9Q8CDN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lrrc9Q8CDN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lrrc9Q8CDN9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lrrc9Q8CDN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lrrc9Q8CDN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lrrc9Q8CDN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lrrc9Q8CDN9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lrrc9Q8CDN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lrrc9Q8CDN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lrrc9Q8CDN9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms