Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms