Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tns3Q5SSZ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Tns3Q5SSZ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tns3Q5SSZ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tns3Q5SSZ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tns3Q5SSZ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Tns3Q5SSZ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tns3Q5SSZ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Tns3Q5SSZ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Tns3Q5SSZ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tns3Q5SSZ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Tns3Q5SSZ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tns3Q5SSZ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Tns3Q5SSZ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Tns3Q5SSZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tns3Q5SSZ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tns3Q5SSZ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tns3Q5SSZ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tns3Q5SSZ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tns3Q5SSZ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tns3Q5SSZ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tns3Q5SSZ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tns3Q5SSZ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tns3Q5SSZ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tns3Q5SSZ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tns3Q5SSZ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tns3Q5SSZ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms