Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YSR3YKR053C 1215 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 UFO1YML088W 2007 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-NL1Q12391 YDR094WYDR094W 336 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 THI74YDR438W 1113 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 SAM1YLR180W 1149 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 YPL168WYPL168W 1293 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 CWC15YDR163W 528 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 LEU9YOR108W 1815 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 YCR087WYCR087W 516 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 MRP20YDR405W 792 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 AKR2YOR034C 2250 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 PAU16YKL224C 372 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 NRT1YOR071C 1797 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 YEL074WYEL074W 339 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 OPI10YOL032W 741 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 ZTA1YBR046C 1005 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 YPL251WYPL251W 303 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 LSM12YHR121W 564 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 TOA2YKL058W 369 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 UTH1YKR042W 1098 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 BRR1YPR057W 1026 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-NL1Q12391 ALP1YNL270C 1722 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 PUS5YLR165C 765 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 AST1YBL069W 1290 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 OYE3YPL171C 1203 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 CCT2YIL142W 1584 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 COQ8YGL119W 1506 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 MOD5YOR274W 1287 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 RPL4BYDR012W 1089 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 PET8YNL003C 855 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 RPL4AYBR031W 1089 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 FIT3YOR383C 615 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 XYL2YLR070C 1071 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 PIC2YER053C 903 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 YGL118CYGL118C 438 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 FAF1YIL019W 1041 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 ARO8YGL202W 1503 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 GND2YGR256W 1479 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 YHP1YDR451C 1062 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 ATG17YLR423C 1254 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 AIM45YPR004C 1035 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-NL1Q12391 HIS2YFR025C 1008 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 RPS14BYJL191W 417 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 YBL081WYBL081W 1107 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 MSF1YPR047W 1410 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 UGP1YKL035W 1500 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 FHN1YGR131W 525 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 SBA1YKL117W 651 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 NAT4YMR069W 858 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 HOS2YGL194C 1359 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 YGL034CYGL034C 366 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 KES1YPL145C 1305 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 LSB6YJL100W 1824 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 YMR103CYMR103C 363 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 SPP2YOR148C 558 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 BET2YPR176C 978 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 MEP3YPR138C 1470 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 ACH1YBL015W 1581 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 SGA1YIL099W 1650 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 RSC8YFR037C 1674 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 FMS1YMR020W 1527 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 FRE6YLL051C 2139 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 MAE1YKL029C 2010 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 APM1YPL259C 1428 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 YMR209CYMR209C 1374 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 SAM2YDR502C 1155 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1A-NL1Q12391 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 NAT5YOR253W 531 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 FLR1YBR008C 1647 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 YPS3YLR121C 1527 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 MPC1YGL080W 393 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 AIM41YOR215C 558 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 ICE2YIL090W 1476 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 BNA3YJL060W 1335 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 YMR147WYMR147W 672 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 SWP1YMR149W 861 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 VPS62YGR141W 1404 nt8.36□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 ZAP1YJL056C 2643 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 NEM1YHR004C 1341 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 AIR1YIL079C 1083 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1A-NL1Q12391 QDR2YIL121W 1629 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 YDL086WYDL086W 822 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 DLD2YDL178W 1593 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 UGA4YDL210W 1716 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 YML079WYML079W 606 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 SEC61YLR378C 1443 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 OXA1YER154W 1209 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 Q0142Q0142 177 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 YLR036CYLR036C 612 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 SCO2YBR024W 906 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 KTR3YBR205W 1215 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 TSC10YBR265W 963 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 STD1YOR047C 1335 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 YLR279WYLR279W 390 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 YNL234WYNL234W 1281 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 MRPL36YBR122C 534 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 SSN3YPL042C 1668 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-NL1Q12391 COX16YJL003W 357 nt8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.7 ms