Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 HXT12YIL170W 1374 nt10.57□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 SAM2YDR502C 1155 nt10.56□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 CPD1YGR247W 720 nt10.56□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 LSB5YCL034W 1065 nt10.56□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 YJL055WYJL055W 738 nt10.55□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 NUC1YJL208C 990 nt10.55□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 NPP1YCR026C 2229 nt10.54□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 SHY1YGR112W 1170 nt10.54□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 ESBP6YNL125C 2022 nt10.54□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.53□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 CYT2YKL087C 675 nt10.53□□□□□ -0.72
CLF1Q12309 ZRT3YKL175W 1512 nt10.51□□□□□ -0.73
CLF1Q12309 CSM1YCR086W 573 nt10.49□□□□□ -0.73
CLF1Q12309 SFP1YLR403W 2052 nt10.48□□□□□ -0.73
CLF1Q12309 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.47□□□□□ -0.73
CLF1Q12309 URA6YKL024C 615 nt10.47□□□□□ -0.73
CLF1Q12309 SEC61YLR378C 1443 nt10.47□□□□□ -0.73
CLF1Q12309 HSL7YBR133C 2484 nt10.46□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 BNI5YNL166C 1347 nt10.45□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 RPT5YOR117W 1305 nt10.45□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 OYE3YPL171C 1203 nt10.45□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 PET8YNL003C 855 nt10.44□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 PHO23YNL097C 993 nt10.44□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 RIB7YBR153W 735 nt10.44□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 YAT1YAR035W 2064 nt10.43□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 UFO1YML088W 2007 nt10.43□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 YJL118WYJL118W 660 nt10.43□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 MET2YNL277W 1461 nt10.41□□□□□ -0.74
CLF1Q12309 RAS2YNL098C 969 nt10.39□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 MSC1YML128C 1542 nt10.38□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 OXA1YER154W 1209 nt10.38□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 CCT5YJR064W 1689 nt10.38□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 HEL2YDR266C 1920 nt10.37□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 YER188WYER188W 720 nt10.37□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 ESS1YJR017C 513 nt10.37□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 RFC1YOR217W 2586 nt10.36□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 CMP2YML057W 1815 nt10.35□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 GAL3YDR009W 1563 nt10.35□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 TAF13YML098W 504 nt10.34□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 THI72YOR192C 1800 nt10.34□□□□□ -0.75
CLF1Q12309 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.33□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.33□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 OYE2YHR179W 1203 nt10.32□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 DTR1YBR180W 1719 nt10.31□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 FUB1YCR076C 753 nt10.31□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 YJL067WYJL067W 351 nt10.31□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 TPS1YBR126C 1488 nt10.3□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 SAM3YPL274W 1764 nt10.3□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 ILV2YMR108W 2064 nt10.3□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 CWC15YDR163W 528 nt10.29□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 PAU5YFL020C 369 nt10.29□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 DLD2YDL178W 1593 nt10.28□□□□□ -0.76
CLF1Q12309 RSC8YFR037C 1674 nt10.27□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 OSH7YHR001W 1314 nt10.27□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 FLR1YBR008C 1647 nt10.24□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 STP3YLR375W 1032 nt10.23□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 SPP2YOR148C 558 nt10.23□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 EAF3YPR023C 1206 nt10.23□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 SEN2YLR105C 1134 nt10.22□□□□□ -0.77
CLF1Q12309 YPS3YLR121C 1527 nt10.21□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 FMS1YMR020W 1527 nt10.21□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 NAP1YKR048C 1254 nt10.2□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 SNZ1YMR096W 894 nt10.2□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 YNL024CYNL024C 741 nt10.2□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 PGC1YPL206C 966 nt10.2□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 LSM5YER146W 282 nt10.19□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 SOL2YCR073W-A 948 nt10.18□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 YMR262WYMR262W 942 nt10.18□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 MHF1YOL086W-A 273 nt10.18□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 IML3YBR107C 738 nt10.18□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 VPS62YGR141W 1404 nt10.17□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 POT1YIL160C 1254 nt10.17□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 YPR126CYPR126C 309 nt10.17□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 DAK2YFL053W 1776 nt10.16□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 DDI1YER143W 1287 nt10.15□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 TMA23YMR269W 636 nt10.15□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 YBR232CYBR232C 360 nt10.15□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 CTI6YPL181W 1521 nt10.15□□□□□ -0.78
CLF1Q12309 INA1YLR413W 2028 nt10.14□□□□□ -0.79
CLF1Q12309 GTB1YDR221W 2109 nt10.14□□□□□ -0.79
CLF1Q12309 GSF2YML048W 1212 nt10.11□□□□□ -0.79
CLF1Q12309 HMG2YLR450W 3138 nt10.11□□□□□ -0.79
CLF1Q12309 RPC82YPR190C 1965 nt10.1□□□□□ -0.79
CLF1Q12309 HEM13YDR044W 987 nt10.1□□□□□ -0.79
CLF1Q12309 HEM14YER014W 1620 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 YDL086WYDL086W 822 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 IMO32YGR031W 1029 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 SPT20YOL148C 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 PAR32YDL173W 888 nt10.07□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 TPO4YOR273C 1980 nt10.05□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.05□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 YJL064WYJL064W 396 nt10.05□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 TUB4YLR212C 1422 nt10.05□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 ACH1YBL015W 1581 nt10.04□□□□□ -0.8
CLF1Q12309 TAT2YOL020W 1779 nt10.02□□□□□ -0.81
CLF1Q12309 ADE8YDR408C 645 nt10.02□□□□□ -0.81
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