Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YNL303WYNL303W 348 nt11.25□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 PCL6YER059W 1263 nt11.24□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 ERV29YGR284C 933 nt11.23□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 ERG29YMR134W 714 nt11.23□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 AME1YBR211C 975 nt11.23□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 SCEIQ0160 708 nt11.22□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 BNA3YJL060W 1335 nt11.22□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 LIP2YLR239C 987 nt11.21□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 PHO89YBR296C 1725 nt11.21□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 SFA1YDL168W 1161 nt11.19□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 YHR145CYHR145C 357 nt11.19□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 YNL234WYNL234W 1281 nt11.19□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 PZF1YPR186C 1290 nt11.19□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 RBG1YAL036C 1110 nt11.18□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 GLR1YPL091W 1452 nt11.18□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 CHA1YCL064C 1083 nt11.17□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 CCE1YKL011C 1062 nt11.17□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 YBL081WYBL081W 1107 nt11.17□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 NAT5YOR253W 531 nt11.17□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 snR189snR189 189 nt11.17□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 GOR1YNL274C 1053 nt11.16□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 NDI1YML120C 1542 nt11.15□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 YIF1YNL263C 945 nt11.15□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 COQ2YNR041C 1119 nt11.15□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 AIM41YOR215C 558 nt11.15□□□□□ -0.62
NCR1Q12200 SHH4YLR164W 507 nt11.13□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 DCI1YOR180C 816 nt11.13□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 YCR102CYCR102C 1107 nt11.12□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 YMR074CYMR074C 438 nt11.12□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 AIM45YPR004C 1035 nt11.12□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 YBR292CYBR292C 372 nt11.12□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 NBP35YGL091C 987 nt11.1□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 MOB1YIL106W 945 nt11.1□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 YPR027CYPR027C 834 nt11.1□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 VHS2YIL135C 1311 nt11.09□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 NUR1YDL089W 1455 nt11.09□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 CTK2YJL006C 972 nt11.09□□□□□ -0.63
NCR1Q12200 SUA5YGL169W 1281 nt11.08□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 DAL2YIR029W 1032 nt11.08□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 NDJ1YOL104C 1059 nt11.08□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 YCR087WYCR087W 516 nt11.07□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 OAZ1YPL052W 879 nt11.07□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 STR3YGL184C 1398 nt11.05□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 RPN8YOR261C 1017 nt11.05□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 RBG2YGR173W 1107 nt11.04□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.04□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 SET6YPL165C 1122 nt11.04□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 KRE28YDR532C 1158 nt11.03□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 YJL225CYJL225C 5277 nt11.03□□□□□ -0.64
NCR1Q12200 ICE2YIL090W 1476 nt11.02□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 YGR283CYGR283C 1026 nt11.02□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 SDS22YKL193C 1017 nt11.02□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 VPS20YMR077C 666 nt11.02□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 YNL319WYNL319W 441 nt11.02□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 MRP20YDR405W 792 nt11.01□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 YJR056CYJR056C 711 nt11.01□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 HAT1YPL001W 1125 nt11□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 BTT1YDR252W 450 nt10.99□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt10.99□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 IZH4YOL101C 939 nt10.99□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 RRS1YOR294W 612 nt10.99□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 TIR3YIL011W 810 nt10.98□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 RTC4YNL254C 1206 nt10.98□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 COX11YPL132W 903 nt10.98□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 RRP15YPR143W 753 nt10.98□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 MRI1YPR118W 1236 nt10.97□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 HOS2YGL194C 1359 nt10.96□□□□□ -0.65
NCR1Q12200 RPF2YKR081C 1035 nt10.95□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 POM34YLR018C 900 nt10.95□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 DUS1YML080W 1272 nt10.95□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 TOM6YOR045W 186 nt10.95□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 YAP6YDR259C 1152 nt10.94□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 TIF34YMR146C 1044 nt10.94□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 AQY2YLL052C 450 nt10.93□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 RCE1YMR274C 948 nt10.93□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 YCL074WYCL074W 927 nt10.92□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 CAB5YDR196C 726 nt10.92□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 RPS14BYJL191W 417 nt10.92□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 TVP38YKR088C 1014 nt10.91□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 YLH47YPR125W 1365 nt10.9□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 RPL4BYDR012W 1089 nt10.9□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 BUD16YEL029C 939 nt10.9□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 RPL4AYBR031W 1089 nt10.9□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 NCE102YPR149W 522 nt10.9□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 HIP1YGR191W 1812 nt10.9□□□□□ -0.66
NCR1Q12200 HAT2YEL056W 1206 nt10.89□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 YAP7YOL028C 738 nt10.89□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 FUR4YBR021W 1902 nt10.89□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.88□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.88□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 OCA4YCR095C 1089 nt10.88□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 PRO1YDR300C 1287 nt10.88□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 PEX2YJL210W 816 nt10.88□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 PCL10YGL134W 1302 nt10.87□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 RXT2YBR095C 1293 nt10.87□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 RPN9YDR427W 1182 nt10.86□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 YLR169WYLR169W 354 nt10.86□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 YMR226CYMR226C 804 nt10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.7 ms