Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 LSR1LSR1 1175 nt8.73□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 YHR219WYHR219W 1875 nt8.72□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 AGP3YFL055W 1677 nt8.72□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 YRF1-2YER190W 5046 nt8.72□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 CWP2YKL096W-A 279 nt8.72□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 YAR028WYAR028W 705 nt8.71□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 HUA1YGR268C 597 nt8.7□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 TIM44YIL022W 1296 nt8.7□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 YPS3YLR121C 1527 nt8.7□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 GAL2YLR081W 1725 nt8.69□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 YFL066CYFL066C 1179 nt8.69□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.69□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 TOM6YOR045W 186 nt8.69□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.68□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 YPL251WYPL251W 303 nt8.68□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 PAU7YAR020C 168 nt8.67□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 FLR1YBR008C 1647 nt8.66□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 MIM1YOL026C 342 nt8.66□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 DAK2YFL053W 1776 nt8.66□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 SFA1YDL168W 1161 nt8.65□□□□□ -1.02
MSH5Q12175 RPD3YNL330C 1302 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 SAM2YDR502C 1155 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 UFD1YGR048W 1086 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 MTG2YHR168W 1557 nt8.64□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 TIF6YPR016C 738 nt8.63□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 LSB5YCL034W 1065 nt8.63□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 RBG1YAL036C 1110 nt8.62□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 PRE6YOL038W 765 nt8.62□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 YMR262WYMR262W 942 nt8.61□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 YDR010CYDR010C 333 nt8.6□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 PEX2YJL210W 816 nt8.6□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 HEM14YER014W 1620 nt8.6□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 DLD2YDL178W 1593 nt8.6□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 TOK1YJL093C 2076 nt8.6□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 FIT1YDR534C 1587 nt8.59□□□□□ -1.03
MSH5Q12175 NRT1YOR071C 1797 nt8.58□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 YMR103CYMR103C 363 nt8.58□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 HBS1YKR084C 1836 nt8.57□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 DLD3YEL071W 1491 nt8.57□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 INH1YDL181W 258 nt8.55□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 AKR2YOR034C 2250 nt8.55□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 LPD1YFL018C 1500 nt8.54□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 HEM13YDR044W 987 nt8.54□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 UTH1YKR042W 1098 nt8.54□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 YLR046CYLR046C 813 nt8.54□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 SEC61YLR378C 1443 nt8.53□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 HIP1YGR191W 1812 nt8.52□□□□□ -1.04
MSH5Q12175 FET5YFL041W 1869 nt8.52□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 LSM5YER146W 282 nt8.52□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 AIM1YAL046C 357 nt8.52□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 RIM2YBR192W 1134 nt8.52□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 MSF1YPR047W 1410 nt8.51□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 RPC31YNL151C 756 nt8.5□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 ALP1YNL270C 1722 nt8.5□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 DUR3YHL016C 2208 nt8.5□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 OXA1YER154W 1209 nt8.49□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 MET28YIR017C 564 nt8.49□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 PHO89YBR296C 1725 nt8.49□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 TPN1YGL186C 1740 nt8.48□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 LEU4YNL104C 1860 nt8.47□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 DUS3YLR401C 2007 nt8.47□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 DPL1YDR294C 1770 nt8.46□□□□□ -1.05
MSH5Q12175 ENT4YLL038C 744 nt8.46□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 KRR1YCL059C 951 nt8.45□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 YFR018CYFR018C 1092 nt8.45□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 VMA11YPL234C 495 nt8.44□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 TIP1YBR067C 633 nt8.44□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 ITR2YOL103W 1830 nt8.44□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 ORT1YOR130C 879 nt8.43□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 POP2YNR052C 1302 nt8.43□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 NPP2YEL016C 1482 nt8.43□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 COQ2YNR041C 1119 nt8.42□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 OSH7YHR001W 1314 nt8.41□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 UBA4YHR111W 1323 nt8.41□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 snR4snR4 186 nt8.41□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 YER188WYER188W 720 nt8.4□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 ADO1YJR105W 1023 nt8.4□□□□□ -1.06
MSH5Q12175 MRPL8YJL063C 717 nt8.39□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 SNX3YOR357C 489 nt8.39□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 ADE16YLR028C 1776 nt8.38□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 MIR1YJR077C 936 nt8.38□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 TRP2YER090W 1524 nt8.37□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 TAT2YOL020W 1779 nt8.37□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 MET30YIL046W 1923 nt8.37□□□□□ -1.07
MSH5Q12175 FUB1YCR076C 753 nt8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms