Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YAT1YAR035W 2064 nt8.15□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 BNI5YNL166C 1347 nt8.15□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 CSM1YCR086W 573 nt8.15□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 OXA1YER154W 1209 nt8.15□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 PHO23YNL097C 993 nt8.15□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 YNR029CYNR029C 1290 nt8.15□□□□□ -1.1
NIP7Q08962 HXT12YIL170W 1374 nt8.14□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 YJL195CYJL195C 702 nt8.14□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 RIB2YOL066C 1776 nt8.14□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 YJL055WYJL055W 738 nt8.12□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 YER188WYER188W 720 nt8.11□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 MSC1YML128C 1542 nt8.11□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 RPT5YOR117W 1305 nt8.1□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 FUN14YAL008W 597 nt8.1□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 RSC8YFR037C 1674 nt8.1□□□□□ -1.11
NIP7Q08962 YJL118WYJL118W 660 nt8.08□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 RAS2YNL098C 969 nt8.08□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 SPP2YOR148C 558 nt8.08□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 DLD2YDL178W 1593 nt8.08□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 RIB7YBR153W 735 nt8.07□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 FLR1YBR008C 1647 nt8.06□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 RPC82YPR190C 1965 nt8.06□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 YPS3YLR121C 1527 nt8.05□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 FMS1YMR020W 1527 nt8.05□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 FUB1YCR076C 753 nt8.05□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 OSH7YHR001W 1314 nt8.04□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 VPS62YGR141W 1404 nt8.04□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 STE4YOR212W 1272 nt8.04□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 SPT20YOL148C 1815 nt8.03□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 YEL008WYEL008W 381 nt8.03□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.03□□□□□ -1.12
NIP7Q08962 CMP2YML057W 1815 nt8.02□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 OYE2YHR179W 1203 nt8.02□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 SAM3YPL274W 1764 nt8.02□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 GAL3YDR009W 1563 nt8□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 YDL086WYDL086W 822 nt7.99□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 RPM1RPM1 483 nt7.99□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 TPS1YBR126C 1488 nt7.99□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 EAF3YPR023C 1206 nt7.97□□□□□ -1.13
NIP7Q08962 SOL2YCR073W-A 948 nt7.96□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 YLR349WYLR349W 507 nt7.96□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ACH1YBL015W 1581 nt7.96□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ILV3YJR016C 1758 nt7.95□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 HEM13YDR044W 987 nt7.95□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 CCT2YIL142W 1584 nt7.94□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 LSM5YER146W 282 nt7.94□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 GPN2YOR262W 1044 nt7.94□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 CCT5YJR064W 1689 nt7.94□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ADH7YCR105W 1086 nt7.93□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 CPD1YGR247W 720 nt7.92□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 YNL024CYNL024C 741 nt7.92□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 OPI10YOL032W 741 nt7.92□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 YOR325WYOR325W 474 nt7.92□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.91□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.91□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.91□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.91□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 THI72YOR192C 1800 nt7.9□□□□□ -1.14
NIP7Q08962 MUP1YGR055W 1725 nt7.89□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 RAD51YER095W 1203 nt7.89□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 DDI1YER143W 1287 nt7.89□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 PAU15YIR041W 375 nt7.89□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 TMA23YMR269W 636 nt7.89□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 TAF13YML098W 504 nt7.88□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 TAT2YOL020W 1779 nt7.87□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 DAK2YFL053W 1776 nt7.86□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 SNZ1YMR096W 894 nt7.85□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 DIG1YPL049C 1359 nt7.84□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 IMO32YGR031W 1029 nt7.84□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 AIM1YAL046C 357 nt7.84□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 YPR126CYPR126C 309 nt7.84□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 IML3YBR107C 738 nt7.84□□□□□ -1.15
NIP7Q08962 YDR455CYDR455C 309 nt7.82□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 ENT4YLL038C 744 nt7.82□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 BET2YPR176C 978 nt7.82□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 QDR2YIL121W 1629 nt7.81□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 ERG13YML126C 1476 nt7.81□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 RRT8YOL048C 1029 nt7.81□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 CTI6YPL181W 1521 nt7.81□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 MHF1YOL086W-A 273 nt7.8□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 ARO8YGL202W 1503 nt7.79□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 ADE8YDR408C 645 nt7.79□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.79□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 YLR046CYLR046C 813 nt7.79□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 LSB6YJL100W 1824 nt7.78□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 POT1YIL160C 1254 nt7.78□□□□□ -1.16
NIP7Q08962 HOL1YNR055C 1761 nt7.77□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 COQ8YGL119W 1506 nt7.77□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 KES1YPL145C 1305 nt7.77□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 SPS100YHR139C 981 nt7.75□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 YMR262WYMR262W 942 nt7.75□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 ESS1YJR017C 513 nt7.74□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 YJR114WYJR114W 393 nt7.74□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 PAU5YFL020C 369 nt7.73□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 GSF2YML048W 1212 nt7.73□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 HIS2YFR025C 1008 nt7.72□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.72□□□□□ -1.17
NIP7Q08962 TVP23YDR084C 600 nt7.7□□□□□ -1.18
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