Protein–RNA interactions for Protein: P36172

VBA5, Vacuolar basic amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA5P36172 CSM1YCR086W 573 nt9.75□□□□□ -0.85
VBA5P36172 VRG4YGL225W 1014 nt9.75□□□□□ -0.85
VBA5P36172 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.75□□□□□ -0.85
VBA5P36172 ZRT3YKL175W 1512 nt9.75□□□□□ -0.85
VBA5P36172 YJL055WYJL055W 738 nt9.74□□□□□ -0.85
VBA5P36172 SSN3YPL042C 1668 nt9.72□□□□□ -0.85
VBA5P36172 YEL008WYEL008W 381 nt9.72□□□□□ -0.85
VBA5P36172 URA6YKL024C 615 nt9.72□□□□□ -0.85
VBA5P36172 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.7□□□□□ -0.86
VBA5P36172 NAR1YNL240C 1476 nt9.7□□□□□ -0.86
VBA5P36172 PAB1YER165W 1734 nt9.69□□□□□ -0.86
VBA5P36172 CYT2YKL087C 675 nt9.69□□□□□ -0.86
VBA5P36172 BNI5YNL166C 1347 nt9.69□□□□□ -0.86
VBA5P36172 OYE3YPL171C 1203 nt9.69□□□□□ -0.86
VBA5P36172 PAU21YOR394W 495 nt9.68□□□□□ -0.86
VBA5P36172 PAU22YPL282C 495 nt9.68□□□□□ -0.86
VBA5P36172 ADH7YCR105W 1086 nt9.67□□□□□ -0.86
VBA5P36172 PHO23YNL097C 993 nt9.67□□□□□ -0.86
VBA5P36172 LSB5YCL034W 1065 nt9.67□□□□□ -0.86
VBA5P36172 SAM2YDR502C 1155 nt9.66□□□□□ -0.86
VBA5P36172 GPN2YOR262W 1044 nt9.66□□□□□ -0.86
VBA5P36172 YJL067WYJL067W 351 nt9.65□□□□□ -0.86
VBA5P36172 SEC61YLR378C 1443 nt9.65□□□□□ -0.87
VBA5P36172 PAU15YIR041W 375 nt9.64□□□□□ -0.87
VBA5P36172 NUC1YJL208C 990 nt9.64□□□□□ -0.87
VBA5P36172 PET8YNL003C 855 nt9.64□□□□□ -0.87
VBA5P36172 MSC1YML128C 1542 nt9.64□□□□□ -0.87
VBA5P36172 SAM3YPL274W 1764 nt9.63□□□□□ -0.87
VBA5P36172 OXA1YER154W 1209 nt9.63□□□□□ -0.87
VBA5P36172 YJL118WYJL118W 660 nt9.63□□□□□ -0.87
VBA5P36172 RPT5YOR117W 1305 nt9.61□□□□□ -0.87
VBA5P36172 CPD1YGR247W 720 nt9.61□□□□□ -0.87
VBA5P36172 GAL3YDR009W 1563 nt9.6□□□□□ -0.87
VBA5P36172 FUB1YCR076C 753 nt9.57□□□□□ -0.88
VBA5P36172 YER188WYER188W 720 nt9.57□□□□□ -0.88
VBA5P36172 ARO7YPR060C 771 nt9.57□□□□□ -0.88
VBA5P36172 FLR1YBR008C 1647 nt9.56□□□□□ -0.88
VBA5P36172 CCT5YJR064W 1689 nt9.56□□□□□ -0.88
VBA5P36172 DLD2YDL178W 1593 nt9.56□□□□□ -0.88
VBA5P36172 RIB7YBR153W 735 nt9.55□□□□□ -0.88
VBA5P36172 RAS2YNL098C 969 nt9.54□□□□□ -0.88
VBA5P36172 RSC8YFR037C 1674 nt9.53□□□□□ -0.88
VBA5P36172 TPS1YBR126C 1488 nt9.53□□□□□ -0.88
VBA5P36172 YAT1YAR035W 2064 nt9.52□□□□□ -0.88
VBA5P36172 FMS1YMR020W 1527 nt9.52□□□□□ -0.88
VBA5P36172 YPS3YLR121C 1527 nt9.51□□□□□ -0.89
VBA5P36172 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA5P36172 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA5P36172 OYE2YHR179W 1203 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA5P36172 RSC4YKR008W 1878 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA5P36172 CWC15YDR163W 528 nt9.49□□□□□ -0.89
VBA5P36172 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.49□□□□□ -0.89
VBA5P36172 SPP2YOR148C 558 nt9.49□□□□□ -0.89
VBA5P36172 EAF3YPR023C 1206 nt9.49□□□□□ -0.89
VBA5P36172 BSP1YPR171W 1731 nt9.48□□□□□ -0.89
VBA5P36172 SNZ1YMR096W 894 nt9.48□□□□□ -0.89
VBA5P36172 ESS1YJR017C 513 nt9.47□□□□□ -0.89
VBA5P36172 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.46□□□□□ -0.9
VBA5P36172 THI72YOR192C 1800 nt9.46□□□□□ -0.9
VBA5P36172 OSH7YHR001W 1314 nt9.46□□□□□ -0.9
VBA5P36172 HEM13YDR044W 987 nt9.45□□□□□ -0.9
VBA5P36172 ACH1YBL015W 1581 nt9.44□□□□□ -0.9
VBA5P36172 INA1YLR413W 2028 nt9.43□□□□□ -0.9
VBA5P36172 SOL2YCR073W-A 948 nt9.41□□□□□ -0.9
VBA5P36172 YPR126CYPR126C 309 nt9.41□□□□□ -0.9
VBA5P36172 RPC82YPR190C 1965 nt9.41□□□□□ -0.9
VBA5P36172 DAK2YFL053W 1776 nt9.4□□□□□ -0.9
VBA5P36172 TAF13YML098W 504 nt9.4□□□□□ -0.9
VBA5P36172 TMA23YMR269W 636 nt9.4□□□□□ -0.9
VBA5P36172 DDI1YER143W 1287 nt9.39□□□□□ -0.91
VBA5P36172 PAU5YFL020C 369 nt9.39□□□□□ -0.91
VBA5P36172 PGC1YPL206C 966 nt9.39□□□□□ -0.91
VBA5P36172 TAT2YOL020W 1779 nt9.38□□□□□ -0.91
VBA5P36172 LSM5YER146W 282 nt9.38□□□□□ -0.91
VBA5P36172 VPS62YGR141W 1404 nt9.37□□□□□ -0.91
VBA5P36172 MAS1YLR163C 1389 nt9.36□□□□□ -0.91
VBA5P36172 CTI6YPL181W 1521 nt9.36□□□□□ -0.91
VBA5P36172 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.35□□□□□ -0.91
VBA5P36172 MHF1YOL086W-A 273 nt9.35□□□□□ -0.91
VBA5P36172 YDR455CYDR455C 309 nt9.34□□□□□ -0.91
VBA5P36172 YMR262WYMR262W 942 nt9.34□□□□□ -0.91
VBA5P36172 IMO32YGR031W 1029 nt9.33□□□□□ -0.92
VBA5P36172 IML3YBR107C 738 nt9.33□□□□□ -0.92
VBA5P36172 STP3YLR375W 1032 nt9.32□□□□□ -0.92
VBA5P36172 YNL024CYNL024C 741 nt9.32□□□□□ -0.92
VBA5P36172 YBR232CYBR232C 360 nt9.32□□□□□ -0.92
VBA5P36172 YDL086WYDL086W 822 nt9.31□□□□□ -0.92
VBA5P36172 POT1YIL160C 1254 nt9.31□□□□□ -0.92
VBA5P36172 YPL041CYPL041C 624 nt9.31□□□□□ -0.92
VBA5P36172 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.3□□□□□ -0.92
VBA5P36172 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.3□□□□□ -0.92
VBA5P36172 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.3□□□□□ -0.92
VBA5P36172 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.3□□□□□ -0.92
VBA5P36172 YOR325WYOR325W 474 nt9.3□□□□□ -0.92
VBA5P36172 SEN2YLR105C 1134 nt9.29□□□□□ -0.92
VBA5P36172 ILV3YJR016C 1758 nt9.27□□□□□ -0.92
VBA5P36172 SPT20YOL148C 1815 nt9.27□□□□□ -0.93
VBA5P36172 URH1YDR400W 1023 nt9.27□□□□□ -0.93
VBA5P36172 LCP5YER127W 1074 nt9.27□□□□□ -0.93
VBA5P36172 NAS6YGR232W 687 nt9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.1 ms