Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Grin2aP35436 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Grin2aP35436 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Grin2aP35436 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Grin2aP35436 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Grin2aP35436 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Grin2aP35436 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Grin2aP35436 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Grin2aP35436 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Grin2aP35436 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Grin2aP35436 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Grin2aP35436 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Grin2aP35436 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Grin2aP35436 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Grin2aP35436 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Grin2aP35436 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Grin2aP35436 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Grin2aP35436 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Grin2aP35436 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Grin2aP35436 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Grin2aP35436 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Grin2aP35436 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Grin2aP35436 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Grin2aP35436 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Grin2aP35436 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Grin2aP35436 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Grin2aP35436 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Grin2aP35436 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Grin2aP35436 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Grin2aP35436 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Grin2aP35436 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Grin2aP35436 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Grin2aP35436 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms