Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tln1P26039 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tln1P26039 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tln1P26039 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tln1P26039 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tln1P26039 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tln1P26039 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tln1P26039 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tln1P26039 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tln1P26039 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tln1P26039 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tln1P26039 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tln1P26039 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tln1P26039 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tln1P26039 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tln1P26039 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tln1P26039 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tln1P26039 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tln1P26039 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tln1P26039 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tln1P26039 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tln1P26039 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tln1P26039 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms