Protein–RNA interactions for Protein: P15179

MSD1, Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSD1P15179 SED1YDR077W 1017 nt9.88□□□□□ -0.83
MSD1P15179 UGA4YDL210W 1716 nt9.87□□□□□ -0.83
MSD1P15179 SAM35YHR083W 990 nt9.87□□□□□ -0.83
MSD1P15179 YJL055WYJL055W 738 nt9.87□□□□□ -0.83
MSD1P15179 YJR114WYJR114W 393 nt9.87□□□□□ -0.83
MSD1P15179 TAF13YML098W 504 nt9.85□□□□□ -0.83
MSD1P15179 SLG1YOR008C 1137 nt9.84□□□□□ -0.83
MSD1P15179 THI72YOR192C 1800 nt9.81□□□□□ -0.84
MSD1P15179 RPC82YPR190C 1965 nt9.81□□□□□ -0.84
MSD1P15179 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.8□□□□□ -0.84
MSD1P15179 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.8□□□□□ -0.84
MSD1P15179 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.8□□□□□ -0.84
MSD1P15179 RIB1YBL033C 1038 nt9.8□□□□□ -0.84
MSD1P15179 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.8□□□□□ -0.84
MSD1P15179 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.8□□□□□ -0.84
MSD1P15179 INA1YLR413W 2028 nt9.79□□□□□ -0.84
MSD1P15179 SPT20YOL148C 1815 nt9.79□□□□□ -0.84
MSD1P15179 LIP1YMR298W 453 nt9.78□□□□□ -0.84
MSD1P15179 Q0010Q0010 387 nt9.77□□□□□ -0.85
MSD1P15179 LSB5YCL034W 1065 nt9.77□□□□□ -0.85
MSD1P15179 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.77□□□□□ -0.85
MSD1P15179 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.77□□□□□ -0.85
MSD1P15179 PAR32YDL173W 888 nt9.76□□□□□ -0.85
MSD1P15179 TIP1YBR067C 633 nt9.74□□□□□ -0.85
MSD1P15179 CSM1YCR086W 573 nt9.73□□□□□ -0.85
MSD1P15179 HEL2YDR266C 1920 nt9.72□□□□□ -0.85
MSD1P15179 RIB7YBR153W 735 nt9.72□□□□□ -0.85
MSD1P15179 YJL118WYJL118W 660 nt9.71□□□□□ -0.86
MSD1P15179 YJR154WYJR154W 1041 nt9.71□□□□□ -0.86
MSD1P15179 YMR262WYMR262W 942 nt9.71□□□□□ -0.86
MSD1P15179 MEP3YPR138C 1470 nt9.71□□□□□ -0.86
MSD1P15179 SOD2YHR008C 702 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 YIA6YIL006W 1122 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 CSM2YIL132C 642 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 ERG6YML008C 1152 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 YPL251WYPL251W 303 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 ZRT3YKL175W 1512 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 GAL3YDR009W 1563 nt9.7□□□□□ -0.86
MSD1P15179 NUC1YJL208C 990 nt9.69□□□□□ -0.86
MSD1P15179 RPT5YOR117W 1305 nt9.68□□□□□ -0.86
MSD1P15179 GSF2YML048W 1212 nt9.68□□□□□ -0.86
MSD1P15179 BRR1YPR057W 1026 nt9.67□□□□□ -0.86
MSD1P15179 YMR103CYMR103C 363 nt9.66□□□□□ -0.86
MSD1P15179 POT1YIL160C 1254 nt9.65□□□□□ -0.86
MSD1P15179 YJL067WYJL067W 351 nt9.65□□□□□ -0.86
MSD1P15179 MHF1YOL086W-A 273 nt9.65□□□□□ -0.86
MSD1P15179 TUB4YLR212C 1422 nt9.65□□□□□ -0.87
MSD1P15179 TOA2YKL058W 369 nt9.64□□□□□ -0.87
MSD1P15179 HXT1YHR094C 1713 nt9.63□□□□□ -0.87
MSD1P15179 YBL086CYBL086C 1401 nt9.63□□□□□ -0.87
MSD1P15179 LEU9YOR108W 1815 nt9.63□□□□□ -0.87
MSD1P15179 SSN3YPL042C 1668 nt9.62□□□□□ -0.87
MSD1P15179 DBP1YPL119C 1854 nt9.62□□□□□ -0.87
MSD1P15179 SNZ1YMR096W 894 nt9.61□□□□□ -0.87
MSD1P15179 PHO23YNL097C 993 nt9.59□□□□□ -0.87
MSD1P15179 YPR126CYPR126C 309 nt9.57□□□□□ -0.88
MSD1P15179 SAM3YPL274W 1764 nt9.57□□□□□ -0.88
MSD1P15179 BNI5YNL166C 1347 nt9.56□□□□□ -0.88
MSD1P15179 YCP4YCR004C 744 nt9.56□□□□□ -0.88
MSD1P15179 SHY1YGR112W 1170 nt9.56□□□□□ -0.88
MSD1P15179 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.55□□□□□ -0.88
MSD1P15179 QDR2YIL121W 1629 nt9.55□□□□□ -0.88
MSD1P15179 APS2YJR058C 444 nt9.54□□□□□ -0.88
MSD1P15179 IML3YBR107C 738 nt9.54□□□□□ -0.88
MSD1P15179 CTI6YPL181W 1521 nt9.54□□□□□ -0.88
MSD1P15179 POP2YNR052C 1302 nt9.54□□□□□ -0.88
MSD1P15179 MUP1YGR055W 1725 nt9.53□□□□□ -0.88
MSD1P15179 GND2YGR256W 1479 nt9.53□□□□□ -0.88
MSD1P15179 MSC1YML128C 1542 nt9.53□□□□□ -0.88
MSD1P15179 SAM2YDR502C 1155 nt9.51□□□□□ -0.89
MSD1P15179 SEC61YLR378C 1443 nt9.5□□□□□ -0.89
MSD1P15179 YNL024CYNL024C 741 nt9.5□□□□□ -0.89
MSD1P15179 TPS1YBR126C 1488 nt9.5□□□□□ -0.89
MSD1P15179 DAK2YFL053W 1776 nt9.5□□□□□ -0.89
MSD1P15179 HOL1YNR055C 1761 nt9.5□□□□□ -0.89
MSD1P15179 RIM8YGL045W 1629 nt9.49□□□□□ -0.89
MSD1P15179 OYE2YHR179W 1203 nt9.49□□□□□ -0.89
MSD1P15179 MET2YNL277W 1461 nt9.48□□□□□ -0.89
MSD1P15179 SAM50YNL026W 1455 nt9.47□□□□□ -0.89
MSD1P15179 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.47□□□□□ -0.89
MSD1P15179 OXA1YER154W 1209 nt9.47□□□□□ -0.89
MSD1P15179 NIF3YGL221C 867 nt9.47□□□□□ -0.89
MSD1P15179 RAS2YNL098C 969 nt9.47□□□□□ -0.89
MSD1P15179 YOR325WYOR325W 474 nt9.47□□□□□ -0.89
MSD1P15179 IGD1YFR017C 588 nt9.46□□□□□ -0.9
MSD1P15179 SFP1YLR403W 2052 nt9.45□□□□□ -0.9
MSD1P15179 ILV3YJR016C 1758 nt9.45□□□□□ -0.9
MSD1P15179 UFO1YML088W 2007 nt9.43□□□□□ -0.9
MSD1P15179 YCR025CYCR025C 411 nt9.43□□□□□ -0.9
MSD1P15179 YER188WYER188W 720 nt9.43□□□□□ -0.9
MSD1P15179 ACO2YJL200C 2370 nt9.41□□□□□ -0.9
MSD1P15179 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.41□□□□□ -0.9
MSD1P15179 YGL114WYGL114W 2178 nt9.41□□□□□ -0.9
MSD1P15179 FUB1YCR076C 753 nt9.4□□□□□ -0.9
MSD1P15179 URA6YKL024C 615 nt9.4□□□□□ -0.9
MSD1P15179 KRE1YNL322C 942 nt9.4□□□□□ -0.9
MSD1P15179 OYE3YPL171C 1203 nt9.4□□□□□ -0.9
MSD1P15179 EAF3YPR023C 1206 nt9.4□□□□□ -0.9
MSD1P15179 CWC15YDR163W 528 nt9.38□□□□□ -0.91
MSD1P15179 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.38□□□□□ -0.91
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