Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Dnmt1P13864 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Dnmt1P13864 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Dnmt1P13864 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
Dnmt1P13864 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Dnmt1P13864 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Dnmt1P13864 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Dnmt1P13864 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Dnmt1P13864 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Dnmt1P13864 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Dnmt1P13864 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Dnmt1P13864 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Dnmt1P13864 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Dnmt1P13864 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Dnmt1P13864 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Dnmt1P13864 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Dnmt1P13864 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Dnmt1P13864 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Dnmt1P13864 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Dnmt1P13864 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Dnmt1P13864 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Dnmt1P13864 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Dnmt1P13864 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Dnmt1P13864 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Dnmt1P13864 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Dnmt1P13864 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Dnmt1P13864 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Dnmt1P13864 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Dnmt1P13864 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Dnmt1P13864 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Dnmt1P13864 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms