Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Atp10aO54827 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Atp10aO54827 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Atp10aO54827 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Atp10aO54827 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Atp10aO54827 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Atp10aO54827 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Atp10aO54827 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Atp10aO54827 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Atp10aO54827 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Atp10aO54827 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Atp10aO54827 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Atp10aO54827 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Atp10aO54827 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Atp10aO54827 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Atp10aO54827 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Atp10aO54827 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Atp10aO54827 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Atp10aO54827 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Atp10aO54827 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Atp10aO54827 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Atp10aO54827 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Atp10aO54827 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Atp10aO54827 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Atp10aO54827 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Atp10aO54827 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Atp10aO54827 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms