Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pira2F8VQ94 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pira2F8VQ94 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pira2F8VQ94 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pira2F8VQ94 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pira2F8VQ94 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pira2F8VQ94 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms