Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 TDA1YMR291W 1761 nt5.16□□□□□ -1.58
SUB2Q07478 FOX2YKR009C 2703 nt5.16□□□□□ -1.58
SUB2Q07478 DAL5YJR152W 1632 nt5.15□□□□□ -1.58
SUB2Q07478 RIM13YMR154C 2184 nt5.15□□□□□ -1.58
SUB2Q07478 REB1YBR049C 2433 nt5.15□□□□□ -1.58
SUB2Q07478 RPL11BYGR085C 525 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 BIG1YHR101C 1008 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 AGE2YIL044C 897 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 RPL11AYPR102C 525 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 snR35snR35 204 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 UBX7YBR273C 1311 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SSY5YJL156C 2100 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLR177WYLR177W 1887 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SCY1YGL083W 2415 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 BEM4YPL161C 1902 nt5.15□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 ALG8YOR067C 1734 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YMR196WYMR196W 3267 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 HTA1YDR225W 399 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SEC53YFL045C 765 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SDP1YIL113W 630 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 DAD2YKR083C 402 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 ARG80YMR042W 534 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 CBP3YPL215W 1008 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YPR096CYPR096C 303 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 RRI2YOL117W 1938 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YJL132WYJL132W 2253 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 TUB3YML124C 1338 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 GPR1YDL035C 2886 nt5.14□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 PAM1YDR251W 2493 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 FMN1YDR236C 657 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 RPS18AYDR450W 441 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YER006C-AYER006C-A 318 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 PBA1YLR199C 831 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 PDP3YLR455W 915 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 RIO2YNL207W 1278 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YOL114CYOL114C 609 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YOL159CYOL159C 516 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SFM1YOR021C 642 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 FRE3YOR381W 2136 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 ARR2YPR200C 393 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YHR182WYHR182W 2358 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 CAF4YKR036C 1932 nt5.13□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 TIF4631YGR162W 2859 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 MGS1YNL218W 1764 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 LYP1YNL268W 1836 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 RAD33YML011C 534 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YML108WYML108W 318 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 AAR2YBL074C 1068 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YPL034WYPL034W 498 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 KAR2YJL034W 2049 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 MUD2YKL074C 1584 nt5.12□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 POL4YCR014C 1749 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SAP4YGL229C 2457 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YER079WYER079W 633 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YGL015CYGL015C 393 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YHL026CYHL026C 948 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YHR138CYHR138C 345 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLR076CYLR076C 423 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 BLM10YFL007W 6432 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 EAP1YKL204W 1899 nt5.11□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SFI1YLL003W 2841 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SSF1YHR066W 1362 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YIL175WYIL175W 318 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 DAS1YJL149W 1992 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLR101CYLR101C 396 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 QCR2YPR191W 1107 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 BIT2YBR270C 1638 nt5.1□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YRR1YOR162C 2433 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 RAD52YML032C 1416 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 TRX3YCR083W 384 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 IRC2YDR112W 309 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YER084WYER084W 387 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 SPT2YER161C 1002 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YFL068WYFL068W 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YIL165CYIL165C 360 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 AIM29YKR074W 468 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 ECM4YKR076W 1113 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 MRPL20YKR085C 588 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YML003WYML003W 873 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 LDS2YOL047C 1071 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 MPD2YOL088C 834 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YBR051WYBR051W 351 nt5.09□□□□□ -1.59
SUB2Q07478 YBR062CYBR062C 543 nt5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.7 ms