Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RCAN1P53805 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms