Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VPREB3Q9UKI3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms