Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRC9Q6ZRR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRC9Q6ZRR7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms