Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NID2Q14112 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NID2Q14112 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NID2Q14112 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NID2Q14112 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NID2Q14112 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NID2Q14112 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NID2Q14112 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NID2Q14112 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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